藤﨑さんみなさんこんにちは。
真木と申します。
エクスプレスカードに設定したSuicaが上手く動作しない件ですが、
SuicaサイトのFAQに、下記の記載がありました。
Ｑ 改札機やレジでSuicaが反応しない。
http://appsuica.okbiz.okwave.jp/faq/show/1525?site_domain=default一部引用します。
以下引用
【重要】Walletアプリにて、Suicaを「エクスプレスカード」に設定しているか。
※エクスプレスカード＝Touch ID／Face IDなしで使用する設定で、設定しない
場合は都度認証操作が必要です。
※エクスプレスカード設定したSuicaが、Walletアプリで「メインカード」＝
一番手前に表示設定されていない状態で、一部店舗の読み取り機器にかざすと
「メインカード」が反応し（Touch ID／Face IDによる認証が必要）、
Suicaが反応しない事象となります。Suicaを「メインカード」にも設定しておく
こともおすすめします。
引用ここまで
つまり、
１、Suicaをエクスプレスカードに設定する。
２、WalletアプリでSuicaを「メインカード」に設定する。
これを実行することで今回の問題は回避できると思われます。
ご参考まで。